Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxd10P28359 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxd10P28359 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxd10P28359 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxd10P28359 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxd10P28359 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxd10P28359 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxd10P28359 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxd10P28359 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxd10P28359 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxd10P28359 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxd10P28359 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxd10P28359 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxd10P28359 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxd10P28359 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxd10P28359 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxd10P28359 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxd10P28359 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxd10P28359 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxd10P28359 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxd10P28359 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxd10P28359 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxd10P28359 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxd10P28359 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxd10P28359 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxd10P28359 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxd10P28359 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxd10P28359 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxd10P28359 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxd10P28359 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxd10P28359 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxd10P28359 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxd10P28359 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxd10P28359 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxd10P28359 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxd10P28359 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxd10P28359 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxd10P28359 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxd10P28359 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxd10P28359 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxd10P28359 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxd10P28359 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxd10P28359 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hoxd10P28359 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hoxd10P28359 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hoxd10P28359 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hoxd10P28359 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hoxd10P28359 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hoxd10P28359 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hoxd10P28359 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hoxd10P28359 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hoxd10P28359 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxd10P28359 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxd10P28359 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxd10P28359 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxd10P28359 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxd10P28359 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxd10P28359 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxd10P28359 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxd10P28359 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxd10P28359 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxd10P28359 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxd10P28359 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxd10P28359 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxd10P28359 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxd10P28359 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxd10P28359 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxd10P28359 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxd10P28359 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxd10P28359 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxd10P28359 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxd10P28359 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxd10P28359 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxd10P28359 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxd10P28359 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxd10P28359 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxd10P28359 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxd10P28359 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxd10P28359 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxd10P28359 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxd10P28359 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxd10P28359 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxd10P28359 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxd10P28359 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxd10P28359 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxd10P28359 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxd10P28359 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxd10P28359 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxd10P28359 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxd10P28359 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxd10P28359 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxd10P28359 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxd10P28359 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxd10P28359 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxd10P28359 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxd10P28359 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxd10P28359 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxd10P28359 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxd10P28359 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxd10P28359 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms