Protein–RNA interactions for Protein: P28310

Defa3, Alpha-defensin 3, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa3P28310 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa3P28310 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa3P28310 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa3P28310 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa3P28310 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa3P28310 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa3P28310 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Epm2aip1-202ENSMUST00000135807 4245 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Defa3P28310 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms