Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gjb1P28230 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gjb1P28230 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gjb1P28230 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gjb1P28230 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gjb1P28230 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gjb1P28230 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gjb1P28230 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gjb1P28230 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gjb1P28230 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gjb1P28230 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gjb1P28230 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gjb1P28230 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gjb1P28230 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gjb1P28230 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gjb1P28230 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gjb1P28230 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gjb1P28230 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gjb1P28230 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gjb1P28230 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gjb1P28230 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gjb1P28230 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gjb1P28230 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gjb1P28230 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gjb1P28230 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gjb1P28230 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gjb1P28230 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gjb1P28230 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gjb1P28230 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gjb1P28230 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gjb1P28230 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gjb1P28230 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gjb1P28230 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gjb1P28230 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gjb1P28230 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gjb1P28230 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gjb1P28230 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gjb1P28230 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gjb1P28230 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gjb1P28230 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gjb1P28230 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gjb1P28230 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gjb1P28230 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gjb1P28230 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gjb1P28230 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gjb1P28230 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gjb1P28230 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gjb1P28230 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gjb1P28230 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gjb1P28230 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gjb1P28230 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gjb1P28230 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gjb1P28230 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gjb1P28230 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gjb1P28230 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gjb1P28230 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gjb1P28230 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gjb1P28230 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gjb1P28230 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gjb1P28230 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gjb1P28230 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gjb1P28230 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gjb1P28230 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gjb1P28230 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gjb1P28230 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gjb1P28230 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gjb1P28230 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gjb1P28230 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gjb1P28230 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gjb1P28230 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gjb1P28230 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gjb1P28230 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gjb1P28230 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gjb1P28230 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gjb1P28230 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gjb1P28230 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gjb1P28230 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gjb1P28230 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gjb1P28230 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gjb1P28230 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gjb1P28230 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gjb1P28230 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gjb1P28230 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gjb1P28230 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gjb1P28230 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gjb1P28230 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gjb1P28230 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gjb1P28230 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gjb1P28230 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gjb1P28230 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gjb1P28230 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gjb1P28230 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gjb1P28230 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gjb1P28230 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gjb1P28230 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gjb1P28230 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gjb1P28230 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gjb1P28230 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gjb1P28230 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gjb1P28230 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.6 ms