Protein–RNA interactions for Protein: P28033

Cebpb, CCAAT/enhancer-binding protein beta, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CebpbP28033 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CebpbP28033 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CebpbP28033 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CebpbP28033 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CebpbP28033 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CebpbP28033 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
CebpbP28033 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CebpbP28033 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
CebpbP28033 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
CebpbP28033 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CebpbP28033 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CebpbP28033 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CebpbP28033 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CebpbP28033 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
CebpbP28033 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CebpbP28033 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CebpbP28033 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CebpbP28033 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CebpbP28033 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CebpbP28033 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CebpbP28033 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CebpbP28033 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CebpbP28033 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CebpbP28033 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
CebpbP28033 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CebpbP28033 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CebpbP28033 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
CebpbP28033 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms