Protein–RNA interactions for Protein: P23475

Xrcc6, X-ray repair cross-complementing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc6P23475 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Xrcc6P23475 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Xrcc6P23475 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Xrcc6P23475 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Xrcc6P23475 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Xrcc6P23475 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Xrcc6P23475 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Xrcc6P23475 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Xrcc6P23475 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Xrcc6P23475 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Xrcc6P23475 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Xrcc6P23475 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Xrcc6P23475 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Xrcc6P23475 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Xrcc6P23475 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Xrcc6P23475 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Xrcc6P23475 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Xrcc6P23475 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Xrcc6P23475 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Xrcc6P23475 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Xrcc6P23475 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Xrcc6P23475 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Xrcc6P23475 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Xrcc6P23475 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Xrcc6P23475 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Xrcc6P23475 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Xrcc6P23475 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Xrcc6P23475 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Xrcc6P23475 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Xrcc6P23475 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Xrcc6P23475 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Xrcc6P23475 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Xrcc6P23475 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Xrcc6P23475 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Xrcc6P23475 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Xrcc6P23475 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Xrcc6P23475 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Xrcc6P23475 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Xrcc6P23475 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Xrcc6P23475 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Xrcc6P23475 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Xrcc6P23475 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Xrcc6P23475 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Xrcc6P23475 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Xrcc6P23475 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Xrcc6P23475 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Xrcc6P23475 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Xrcc6P23475 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Xrcc6P23475 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Xrcc6P23475 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Xrcc6P23475 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Xrcc6P23475 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Xrcc6P23475 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Xrcc6P23475 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Xrcc6P23475 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Xrcc6P23475 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Xrcc6P23475 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Xrcc6P23475 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Xrcc6P23475 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Xrcc6P23475 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Xrcc6P23475 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Xrcc6P23475 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Xrcc6P23475 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Xrcc6P23475 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xrcc6P23475 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xrcc6P23475 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xrcc6P23475 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xrcc6P23475 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xrcc6P23475 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xrcc6P23475 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xrcc6P23475 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xrcc6P23475 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xrcc6P23475 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xrcc6P23475 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Xrcc6P23475 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xrcc6P23475 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xrcc6P23475 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xrcc6P23475 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xrcc6P23475 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xrcc6P23475 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xrcc6P23475 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Xrcc6P23475 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Xrcc6P23475 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xrcc6P23475 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xrcc6P23475 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xrcc6P23475 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xrcc6P23475 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xrcc6P23475 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xrcc6P23475 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xrcc6P23475 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xrcc6P23475 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xrcc6P23475 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xrcc6P23475 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xrcc6P23475 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xrcc6P23475 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xrcc6P23475 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Xrcc6P23475 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Xrcc6P23475 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Xrcc6P23475 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Xrcc6P23475 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms