Protein–RNA interactions for Protein: P23463

Hoxd8, Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8P23463 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Hoxd8P23463 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxd8P23463 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxd8P23463 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxd8P23463 Gm37102-201ENSMUST00000195740 1105 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxd8P23463 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxd8P23463 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxd8P23463 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxd8P23463 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxd8P23463 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxd8P23463 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxd8P23463 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxd8P23463 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxd8P23463 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxd8P23463 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Hoxd8P23463 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxd8P23463 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxd8P23463 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxd8P23463 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxd8P23463 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxd8P23463 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxd8P23463 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxd8P23463 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxd8P23463 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxd8P23463 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxd8P23463 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxd8P23463 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxd8P23463 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxd8P23463 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxd8P23463 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxd8P23463 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxd8P23463 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxd8P23463 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxd8P23463 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxd8P23463 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxd8P23463 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxd8P23463 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxd8P23463 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Hoxd8P23463 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxd8P23463 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxd8P23463 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxd8P23463 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxd8P23463 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxd8P23463 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxd8P23463 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxd8P23463 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxd8P23463 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxd8P23463 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxd8P23463 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxd8P23463 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Hoxd8P23463 Gm13546-201ENSMUST00000135735 401 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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