Protein–RNA interactions for Protein: P22605

Rarb, Retinoic acid receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RarbP22605 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RarbP22605 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RarbP22605 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RarbP22605 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RarbP22605 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RarbP22605 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RarbP22605 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RarbP22605 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RarbP22605 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RarbP22605 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RarbP22605 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RarbP22605 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RarbP22605 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
RarbP22605 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RarbP22605 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RarbP22605 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RarbP22605 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RarbP22605 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RarbP22605 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
RarbP22605 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RarbP22605 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RarbP22605 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
RarbP22605 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RarbP22605 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RarbP22605 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RarbP22605 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RarbP22605 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RarbP22605 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RarbP22605 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RarbP22605 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RarbP22605 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RarbP22605 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RarbP22605 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RarbP22605 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RarbP22605 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RarbP22605 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RarbP22605 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RarbP22605 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
RarbP22605 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RarbP22605 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RarbP22605 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RarbP22605 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RarbP22605 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RarbP22605 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RarbP22605 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RarbP22605 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RarbP22605 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RarbP22605 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RarbP22605 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RarbP22605 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RarbP22605 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RarbP22605 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RarbP22605 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
RarbP22605 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
RarbP22605 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RarbP22605 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RarbP22605 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RarbP22605 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RarbP22605 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RarbP22605 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RarbP22605 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RarbP22605 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RarbP22605 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RarbP22605 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RarbP22605 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RarbP22605 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RarbP22605 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RarbP22605 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RarbP22605 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RarbP22605 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RarbP22605 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RarbP22605 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RarbP22605 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RarbP22605 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RarbP22605 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RarbP22605 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RarbP22605 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RarbP22605 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RarbP22605 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RarbP22605 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RarbP22605 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RarbP22605 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RarbP22605 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RarbP22605 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RarbP22605 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RarbP22605 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RarbP22605 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RarbP22605 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RarbP22605 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RarbP22605 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RarbP22605 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RarbP22605 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RarbP22605 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RarbP22605 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RarbP22605 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RarbP22605 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RarbP22605 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RarbP22605 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RarbP22605 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RarbP22605 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.9 ms