Protein–RNA interactions for Protein: P22387

Edn1, Endothelin-1, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edn1P22387 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Edn1P22387 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Edn1P22387 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Edn1P22387 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Edn1P22387 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Edn1P22387 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Edn1P22387 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Edn1P22387 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Edn1P22387 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Edn1P22387 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Edn1P22387 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Edn1P22387 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Edn1P22387 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Edn1P22387 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Edn1P22387 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Edn1P22387 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Edn1P22387 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Edn1P22387 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Edn1P22387 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Edn1P22387 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Edn1P22387 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Edn1P22387 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Edn1P22387 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Edn1P22387 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Edn1P22387 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Edn1P22387 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Edn1P22387 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Edn1P22387 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Edn1P22387 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Edn1P22387 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Edn1P22387 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Edn1P22387 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Edn1P22387 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Edn1P22387 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Edn1P22387 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Edn1P22387 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Edn1P22387 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Edn1P22387 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Edn1P22387 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Edn1P22387 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Edn1P22387 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Edn1P22387 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Edn1P22387 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Edn1P22387 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Edn1P22387 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Edn1P22387 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Edn1P22387 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Edn1P22387 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Edn1P22387 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Edn1P22387 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Edn1P22387 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Edn1P22387 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Edn1P22387 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Edn1P22387 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Edn1P22387 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Edn1P22387 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Edn1P22387 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Edn1P22387 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Edn1P22387 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Edn1P22387 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Edn1P22387 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Edn1P22387 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Edn1P22387 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Edn1P22387 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Edn1P22387 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Edn1P22387 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Edn1P22387 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Edn1P22387 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Edn1P22387 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Edn1P22387 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Edn1P22387 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Edn1P22387 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Edn1P22387 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Edn1P22387 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Edn1P22387 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Edn1P22387 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Edn1P22387 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Edn1P22387 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Edn1P22387 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Edn1P22387 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Edn1P22387 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Edn1P22387 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Edn1P22387 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Edn1P22387 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Edn1P22387 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Edn1P22387 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Edn1P22387 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Edn1P22387 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Edn1P22387 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Edn1P22387 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Edn1P22387 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Edn1P22387 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Edn1P22387 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Edn1P22387 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Edn1P22387 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Edn1P22387 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Edn1P22387 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Edn1P22387 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Edn1P22387 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Edn1P22387 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms