Protein–RNA interactions for Protein: P21237

Bdnf, Brain-derived neurotrophic factor, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BdnfP21237 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
BdnfP21237 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
BdnfP21237 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
BdnfP21237 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
BdnfP21237 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
BdnfP21237 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
BdnfP21237 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
BdnfP21237 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
BdnfP21237 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
BdnfP21237 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
BdnfP21237 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
BdnfP21237 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
BdnfP21237 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
BdnfP21237 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
BdnfP21237 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
BdnfP21237 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
BdnfP21237 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
BdnfP21237 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
BdnfP21237 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
BdnfP21237 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
BdnfP21237 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BdnfP21237 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
BdnfP21237 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BdnfP21237 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BdnfP21237 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
BdnfP21237 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BdnfP21237 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BdnfP21237 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BdnfP21237 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BdnfP21237 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BdnfP21237 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
BdnfP21237 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
BdnfP21237 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BdnfP21237 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BdnfP21237 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
BdnfP21237 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
BdnfP21237 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BdnfP21237 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BdnfP21237 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
BdnfP21237 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BdnfP21237 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BdnfP21237 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
BdnfP21237 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BdnfP21237 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BdnfP21237 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BdnfP21237 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
BdnfP21237 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
BdnfP21237 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
BdnfP21237 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
BdnfP21237 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
BdnfP21237 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
BdnfP21237 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
BdnfP21237 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
BdnfP21237 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
BdnfP21237 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
BdnfP21237 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
BdnfP21237 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
BdnfP21237 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
BdnfP21237 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
BdnfP21237 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
BdnfP21237 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
BdnfP21237 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
BdnfP21237 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
BdnfP21237 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
BdnfP21237 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
BdnfP21237 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
BdnfP21237 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
BdnfP21237 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
BdnfP21237 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
BdnfP21237 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
BdnfP21237 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
BdnfP21237 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
BdnfP21237 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
BdnfP21237 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
BdnfP21237 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
BdnfP21237 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
BdnfP21237 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
BdnfP21237 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
BdnfP21237 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
BdnfP21237 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
BdnfP21237 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
BdnfP21237 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BdnfP21237 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
BdnfP21237 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BdnfP21237 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BdnfP21237 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BdnfP21237 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
BdnfP21237 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
BdnfP21237 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
BdnfP21237 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
BdnfP21237 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
BdnfP21237 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BdnfP21237 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
BdnfP21237 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
BdnfP21237 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
BdnfP21237 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BdnfP21237 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BdnfP21237 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BdnfP21237 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BdnfP21237 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms