Protein–RNA interactions for Protein: P21107

Tpm3, Tropomyosin alpha-3 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3P21107 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tpm3P21107 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Tpm3P21107 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tpm3P21107 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tpm3P21107 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Tpm3P21107 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tpm3P21107 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tpm3P21107 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tpm3P21107 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Tpm3P21107 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Tpm3P21107 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Tpm3P21107 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tpm3P21107 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tpm3P21107 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tpm3P21107 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tpm3P21107 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tpm3P21107 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tpm3P21107 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tpm3P21107 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tpm3P21107 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tpm3P21107 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tpm3P21107 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tpm3P21107 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Tpm3P21107 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tpm3P21107 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tpm3P21107 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tpm3P21107 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tpm3P21107 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tpm3P21107 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tpm3P21107 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tpm3P21107 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tpm3P21107 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tpm3P21107 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tpm3P21107 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tpm3P21107 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tpm3P21107 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tpm3P21107 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tpm3P21107 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tpm3P21107 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tpm3P21107 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tpm3P21107 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tpm3P21107 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tpm3P21107 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tpm3P21107 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tpm3P21107 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tpm3P21107 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tpm3P21107 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tpm3P21107 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tpm3P21107 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Tpm3P21107 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tpm3P21107 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tpm3P21107 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tpm3P21107 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tpm3P21107 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tpm3P21107 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tpm3P21107 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tpm3P21107 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tpm3P21107 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tpm3P21107 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tpm3P21107 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tpm3P21107 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tpm3P21107 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Tpm3P21107 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tpm3P21107 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tpm3P21107 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tpm3P21107 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tpm3P21107 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tpm3P21107 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Tpm3P21107 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tpm3P21107 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tpm3P21107 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tpm3P21107 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tpm3P21107 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tpm3P21107 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tpm3P21107 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tpm3P21107 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tpm3P21107 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tpm3P21107 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tpm3P21107 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tpm3P21107 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tpm3P21107 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tpm3P21107 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Tpm3P21107 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tpm3P21107 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tpm3P21107 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Tpm3P21107 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tpm3P21107 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tpm3P21107 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tpm3P21107 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tpm3P21107 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tpm3P21107 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tpm3P21107 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tpm3P21107 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tpm3P21107 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tpm3P21107 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tpm3P21107 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tpm3P21107 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tpm3P21107 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tpm3P21107 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tpm3P21107 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms