Protein–RNA interactions for Protein: P20801

Tnnc2, Troponin C, skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc2P20801 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tnnc2P20801 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tnnc2P20801 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tnnc2P20801 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tnnc2P20801 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tnnc2P20801 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tnnc2P20801 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tnnc2P20801 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tnnc2P20801 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tnnc2P20801 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnnc2P20801 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnnc2P20801 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnnc2P20801 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnnc2P20801 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnnc2P20801 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnnc2P20801 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnnc2P20801 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnnc2P20801 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnnc2P20801 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnnc2P20801 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnnc2P20801 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnnc2P20801 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnnc2P20801 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnnc2P20801 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnnc2P20801 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnnc2P20801 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnnc2P20801 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnnc2P20801 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnnc2P20801 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnnc2P20801 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnnc2P20801 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnnc2P20801 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnnc2P20801 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnnc2P20801 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnnc2P20801 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnnc2P20801 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnnc2P20801 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnnc2P20801 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnnc2P20801 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnnc2P20801 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnnc2P20801 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tnnc2P20801 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnnc2P20801 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnnc2P20801 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnnc2P20801 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnnc2P20801 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnnc2P20801 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnnc2P20801 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnnc2P20801 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnnc2P20801 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tnnc2P20801 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.7 ms