Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Fcer1aP20489 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.5 ms