Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
PrkcaP20444 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms