Protein–RNA interactions for Protein: P20293

T, Brachyury protein, mousemouse

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Length 436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP20293 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TP20293 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TP20293 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TP20293 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TP20293 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TP20293 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TP20293 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TP20293 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
TP20293 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TP20293 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TP20293 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
TP20293 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TP20293 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TP20293 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TP20293 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TP20293 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TP20293 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TP20293 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
TP20293 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TP20293 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TP20293 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TP20293 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TP20293 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TP20293 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TP20293 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TP20293 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TP20293 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
TP20293 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TP20293 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TP20293 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TP20293 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TP20293 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TP20293 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TP20293 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TP20293 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TP20293 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TP20293 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TP20293 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
TP20293 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
TP20293 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
TP20293 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
TP20293 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
TP20293 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
TP20293 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
TP20293 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
TP20293 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
TP20293 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TP20293 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TP20293 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
TP20293 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
TP20293 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
TP20293 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
TP20293 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
TP20293 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
TP20293 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
TP20293 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
TP20293 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
TP20293 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
TP20293 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
TP20293 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
TP20293 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
TP20293 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
TP20293 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
TP20293 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
TP20293 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
TP20293 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
TP20293 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
TP20293 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
TP20293 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
TP20293 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
TP20293 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
TP20293 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
TP20293 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
TP20293 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TP20293 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
TP20293 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TP20293 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TP20293 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TP20293 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TP20293 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TP20293 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TP20293 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TP20293 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TP20293 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TP20293 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
TP20293 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TP20293 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TP20293 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TP20293 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TP20293 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TP20293 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TP20293 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TP20293 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TP20293 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
TP20293 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TP20293 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TP20293 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TP20293 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TP20293 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TP20293 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
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