Protein–RNA interactions for Protein: P19253

Rpl13a, 60S ribosomal protein L13a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 203 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl13aP19253 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Dhx30-212ENSMUST00000197928 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Srgap3-202ENSMUST00000088373 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rpl13aP19253 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Rpl13aP19253 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
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