Protein–RNA interactions for Protein: P19228

Csn1s1, Alpha-S1-casein, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csn1s1P19228 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Csn1s1P19228 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Csn1s1P19228 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Csn1s1P19228 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Csn1s1P19228 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Csn1s1P19228 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Csn1s1P19228 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Csn1s1P19228 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Csn1s1P19228 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Csn1s1P19228 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Csn1s1P19228 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Csn1s1P19228 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Csn1s1P19228 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Csn1s1P19228 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Csn1s1P19228 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Csn1s1P19228 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Csn1s1P19228 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Csn1s1P19228 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Csn1s1P19228 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Csn1s1P19228 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Csn1s1P19228 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Csn1s1P19228 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Csn1s1P19228 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Csn1s1P19228 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Csn1s1P19228 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Csn1s1P19228 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Csn1s1P19228 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Csn1s1P19228 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Csn1s1P19228 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Csn1s1P19228 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Csn1s1P19228 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Csn1s1P19228 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Csn1s1P19228 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Csn1s1P19228 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Csn1s1P19228 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Csn1s1P19228 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Csn1s1P19228 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Csn1s1P19228 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Csn1s1P19228 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Csn1s1P19228 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Csn1s1P19228 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Csn1s1P19228 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Csn1s1P19228 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Csn1s1P19228 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Csn1s1P19228 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Csn1s1P19228 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Csn1s1P19228 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Csn1s1P19228 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Csn1s1P19228 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Csn1s1P19228 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Csn1s1P19228 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Csn1s1P19228 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Csn1s1P19228 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Csn1s1P19228 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Csn1s1P19228 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Csn1s1P19228 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Csn1s1P19228 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Csn1s1P19228 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Csn1s1P19228 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Csn1s1P19228 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Csn1s1P19228 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Csn1s1P19228 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Csn1s1P19228 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Csn1s1P19228 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Csn1s1P19228 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Csn1s1P19228 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Csn1s1P19228 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Csn1s1P19228 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Csn1s1P19228 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Csn1s1P19228 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Csn1s1P19228 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Csn1s1P19228 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Csn1s1P19228 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Csn1s1P19228 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Csn1s1P19228 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Csn1s1P19228 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Csn1s1P19228 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Csn1s1P19228 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Csn1s1P19228 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Csn1s1P19228 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Csn1s1P19228 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Csn1s1P19228 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Csn1s1P19228 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Csn1s1P19228 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Csn1s1P19228 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Csn1s1P19228 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Csn1s1P19228 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Csn1s1P19228 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Csn1s1P19228 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Csn1s1P19228 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Csn1s1P19228 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Csn1s1P19228 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Csn1s1P19228 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Csn1s1P19228 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Csn1s1P19228 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Csn1s1P19228 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Csn1s1P19228 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Csn1s1P19228 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Csn1s1P19228 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Csn1s1P19228 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
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