Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnnc1P19123 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnnc1P19123 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnnc1P19123 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnnc1P19123 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnnc1P19123 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnnc1P19123 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnnc1P19123 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnnc1P19123 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnnc1P19123 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnnc1P19123 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnnc1P19123 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnnc1P19123 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnnc1P19123 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnnc1P19123 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnnc1P19123 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnnc1P19123 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnnc1P19123 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnnc1P19123 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnnc1P19123 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnnc1P19123 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnnc1P19123 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnnc1P19123 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnnc1P19123 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnnc1P19123 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnnc1P19123 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnnc1P19123 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnnc1P19123 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnnc1P19123 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnnc1P19123 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnnc1P19123 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnnc1P19123 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnnc1P19123 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnnc1P19123 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnnc1P19123 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnnc1P19123 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnnc1P19123 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnnc1P19123 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnnc1P19123 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnnc1P19123 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnnc1P19123 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnnc1P19123 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnnc1P19123 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnnc1P19123 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnnc1P19123 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnnc1P19123 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnnc1P19123 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnnc1P19123 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnnc1P19123 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnnc1P19123 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnnc1P19123 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnnc1P19123 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnnc1P19123 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnnc1P19123 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnnc1P19123 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnnc1P19123 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnnc1P19123 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnnc1P19123 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnnc1P19123 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnnc1P19123 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnnc1P19123 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnnc1P19123 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnnc1P19123 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnnc1P19123 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnnc1P19123 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnnc1P19123 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnnc1P19123 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnnc1P19123 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnnc1P19123 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnnc1P19123 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnnc1P19123 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnnc1P19123 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnnc1P19123 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnnc1P19123 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnnc1P19123 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnnc1P19123 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnnc1P19123 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnnc1P19123 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnnc1P19123 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnnc1P19123 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnnc1P19123 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnnc1P19123 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnnc1P19123 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tnnc1P19123 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tnnc1P19123 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tnnc1P19123 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tnnc1P19123 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tnnc1P19123 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tnnc1P19123 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tnnc1P19123 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tnnc1P19123 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tnnc1P19123 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tnnc1P19123 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnnc1P19123 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnnc1P19123 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnnc1P19123 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnnc1P19123 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnnc1P19123 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnnc1P19123 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnnc1P19123 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms