Protein–RNA interactions for Protein: P17679

Gata1, Erythroid transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata1P17679 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gata1P17679 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gata1P17679 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gata1P17679 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gata1P17679 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gata1P17679 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gata1P17679 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gata1P17679 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gata1P17679 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gata1P17679 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gata1P17679 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gata1P17679 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gata1P17679 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gata1P17679 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gata1P17679 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gata1P17679 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gata1P17679 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gata1P17679 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gata1P17679 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gata1P17679 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gata1P17679 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gata1P17679 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gata1P17679 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gata1P17679 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gata1P17679 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gata1P17679 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gata1P17679 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gata1P17679 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gata1P17679 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gata1P17679 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gata1P17679 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gata1P17679 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gata1P17679 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gata1P17679 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gata1P17679 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gata1P17679 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gata1P17679 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gata1P17679 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gata1P17679 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gata1P17679 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gata1P17679 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gata1P17679 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gata1P17679 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gata1P17679 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gata1P17679 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gata1P17679 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gata1P17679 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gata1P17679 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gata1P17679 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gata1P17679 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gata1P17679 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gata1P17679 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gata1P17679 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gata1P17679 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gata1P17679 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gata1P17679 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gata1P17679 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gata1P17679 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gata1P17679 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gata1P17679 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gata1P17679 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gata1P17679 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gata1P17679 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gata1P17679 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gata1P17679 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gata1P17679 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gata1P17679 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gata1P17679 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gata1P17679 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gata1P17679 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gata1P17679 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gata1P17679 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gata1P17679 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gata1P17679 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gata1P17679 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gata1P17679 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gata1P17679 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gata1P17679 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gata1P17679 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gata1P17679 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gata1P17679 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gata1P17679 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gata1P17679 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gata1P17679 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gata1P17679 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gata1P17679 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gata1P17679 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gata1P17679 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gata1P17679 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gata1P17679 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gata1P17679 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gata1P17679 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gata1P17679 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gata1P17679 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gata1P17679 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gata1P17679 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gata1P17679 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gata1P17679 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gata1P17679 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gata1P17679 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms