Protein–RNA interactions for Protein: P15919

Rag1, V(D)J recombination-activating protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rag1P15919 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rag1P15919 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rag1P15919 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rag1P15919 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rag1P15919 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rag1P15919 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rag1P15919 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rag1P15919 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rag1P15919 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rag1P15919 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rag1P15919 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Rag1P15919 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rag1P15919 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rag1P15919 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rag1P15919 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rag1P15919 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Rag1P15919 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rag1P15919 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rag1P15919 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rag1P15919 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rag1P15919 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rag1P15919 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rag1P15919 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rag1P15919 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rag1P15919 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rag1P15919 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rag1P15919 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rag1P15919 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rag1P15919 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rag1P15919 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rag1P15919 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rag1P15919 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rag1P15919 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rag1P15919 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rag1P15919 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rag1P15919 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rag1P15919 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rag1P15919 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Rag1P15919 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rag1P15919 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Rag1P15919 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rag1P15919 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rag1P15919 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rag1P15919 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rag1P15919 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rag1P15919 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rag1P15919 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rag1P15919 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Rag1P15919 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rag1P15919 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rag1P15919 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rag1P15919 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rag1P15919 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rag1P15919 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rag1P15919 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rag1P15919 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rag1P15919 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rag1P15919 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Rag1P15919 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rag1P15919 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Rag1P15919 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rag1P15919 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rag1P15919 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rag1P15919 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rag1P15919 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rag1P15919 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rag1P15919 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rag1P15919 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rag1P15919 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rag1P15919 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rag1P15919 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rag1P15919 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Rag1P15919 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rag1P15919 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Rag1P15919 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rag1P15919 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rag1P15919 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rag1P15919 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rag1P15919 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rag1P15919 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Rag1P15919 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rag1P15919 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rag1P15919 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rag1P15919 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rag1P15919 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rag1P15919 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rag1P15919 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Rag1P15919 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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