Protein–RNA interactions for Protein: P15533

Trim30a, Tripartite motif-containing protein 30A, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30aP15533 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim30aP15533 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim30aP15533 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim30aP15533 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim30aP15533 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim30aP15533 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim30aP15533 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim30aP15533 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim30aP15533 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim30aP15533 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim30aP15533 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim30aP15533 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim30aP15533 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim30aP15533 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim30aP15533 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim30aP15533 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim30aP15533 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim30aP15533 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim30aP15533 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim30aP15533 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim30aP15533 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim30aP15533 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim30aP15533 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim30aP15533 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim30aP15533 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim30aP15533 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim30aP15533 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim30aP15533 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim30aP15533 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim30aP15533 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim30aP15533 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim30aP15533 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim30aP15533 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim30aP15533 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim30aP15533 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim30aP15533 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim30aP15533 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Trim30aP15533 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim30aP15533 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim30aP15533 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim30aP15533 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim30aP15533 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim30aP15533 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim30aP15533 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim30aP15533 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim30aP15533 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim30aP15533 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim30aP15533 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim30aP15533 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim30aP15533 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim30aP15533 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim30aP15533 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim30aP15533 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim30aP15533 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim30aP15533 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim30aP15533 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim30aP15533 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim30aP15533 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim30aP15533 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim30aP15533 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trim30aP15533 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim30aP15533 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim30aP15533 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim30aP15533 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim30aP15533 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim30aP15533 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim30aP15533 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim30aP15533 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim30aP15533 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim30aP15533 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim30aP15533 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim30aP15533 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim30aP15533 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim30aP15533 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim30aP15533 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim30aP15533 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim30aP15533 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim30aP15533 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim30aP15533 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim30aP15533 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim30aP15533 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim30aP15533 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim30aP15533 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim30aP15533 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim30aP15533 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim30aP15533 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim30aP15533 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim30aP15533 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim30aP15533 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim30aP15533 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trim30aP15533 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim30aP15533 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim30aP15533 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim30aP15533 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim30aP15533 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim30aP15533 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim30aP15533 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim30aP15533 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim30aP15533 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trim30aP15533 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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