Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
Vpreb2P13373 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms