Protein–RNA interactions for Protein: P11477

Defa1, Alpha-defensin 1, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa1P11477 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa1P11477 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa1P11477 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
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Defa1P11477 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Defa1P11477 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa1P11477 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa1P11477 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa1P11477 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa1P11477 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa1P11477 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa1P11477 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa1P11477 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa1P11477 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa1P11477 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa1P11477 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa1P11477 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa1P11477 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa1P11477 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Defa1P11477 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa1P11477 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa1P11477 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa1P11477 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa1P11477 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa1P11477 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Defa1P11477 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Defa1P11477 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Defa1P11477 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa1P11477 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Defa1P11477 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
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Defa1P11477 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa1P11477 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Defa1P11477 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Defa1P11477 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Defa1P11477 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Defa1P11477 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Defa1P11477 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Defa1P11477 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Defa1P11477 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Defa1P11477 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Defa1P11477 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Defa1P11477 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Defa1P11477 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Defa1P11477 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Defa1P11477 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Defa1P11477 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Defa1P11477 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Defa1P11477 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Defa1P11477 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Defa1P11477 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Defa1P11477 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Defa1P11477 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Defa1P11477 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Defa1P11477 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Defa1P11477 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Defa1P11477 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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