Protein–RNA interactions for Protein: P10820

Prf1, Perforin-1, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prf1P10820 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prf1P10820 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prf1P10820 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prf1P10820 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prf1P10820 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Prf1P10820 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prf1P10820 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prf1P10820 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prf1P10820 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prf1P10820 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prf1P10820 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prf1P10820 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prf1P10820 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prf1P10820 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prf1P10820 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prf1P10820 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prf1P10820 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prf1P10820 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prf1P10820 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prf1P10820 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prf1P10820 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prf1P10820 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prf1P10820 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prf1P10820 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prf1P10820 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prf1P10820 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prf1P10820 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prf1P10820 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prf1P10820 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prf1P10820 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prf1P10820 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prf1P10820 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prf1P10820 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prf1P10820 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prf1P10820 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prf1P10820 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Prf1P10820 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prf1P10820 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Prf1P10820 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prf1P10820 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prf1P10820 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prf1P10820 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Prf1P10820 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prf1P10820 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prf1P10820 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prf1P10820 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prf1P10820 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prf1P10820 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prf1P10820 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prf1P10820 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prf1P10820 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prf1P10820 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prf1P10820 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prf1P10820 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prf1P10820 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prf1P10820 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prf1P10820 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prf1P10820 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prf1P10820 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prf1P10820 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prf1P10820 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prf1P10820 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prf1P10820 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prf1P10820 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prf1P10820 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prf1P10820 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prf1P10820 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prf1P10820 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prf1P10820 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Prf1P10820 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Prf1P10820 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prf1P10820 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prf1P10820 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prf1P10820 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prf1P10820 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prf1P10820 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prf1P10820 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Prf1P10820 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prf1P10820 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Prf1P10820 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prf1P10820 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prf1P10820 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prf1P10820 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prf1P10820 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prf1P10820 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prf1P10820 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prf1P10820 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Prf1P10820 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Prf1P10820 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Prf1P10820 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Prf1P10820 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Prf1P10820 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Prf1P10820 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Prf1P10820 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Prf1P10820 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Prf1P10820 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Prf1P10820 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Prf1P10820 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Prf1P10820 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Prf1P10820 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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