Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

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Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TtrP07309 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TtrP07309 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
TtrP07309 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TtrP07309 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TtrP07309 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TtrP07309 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
TtrP07309 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TtrP07309 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
TtrP07309 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TtrP07309 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TtrP07309 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
TtrP07309 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
TtrP07309 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
TtrP07309 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TtrP07309 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
TtrP07309 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
TtrP07309 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
TtrP07309 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TtrP07309 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TtrP07309 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TtrP07309 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
TtrP07309 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
TtrP07309 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TtrP07309 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TtrP07309 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
TtrP07309 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
TtrP07309 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TtrP07309 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TtrP07309 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TtrP07309 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TtrP07309 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
TtrP07309 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TtrP07309 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
TtrP07309 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TtrP07309 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TtrP07309 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
TtrP07309 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
TtrP07309 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
TtrP07309 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
TtrP07309 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
TtrP07309 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
TtrP07309 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
TtrP07309 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
TtrP07309 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
TtrP07309 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
TtrP07309 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
TtrP07309 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
TtrP07309 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
TtrP07309 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
TtrP07309 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
TtrP07309 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
TtrP07309 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
TtrP07309 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
TtrP07309 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
TtrP07309 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
TtrP07309 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
TtrP07309 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
TtrP07309 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
TtrP07309 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
TtrP07309 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
TtrP07309 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
TtrP07309 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
TtrP07309 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
TtrP07309 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
TtrP07309 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
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TtrP07309 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
TtrP07309 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
TtrP07309 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
TtrP07309 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
TtrP07309 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
TtrP07309 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
TtrP07309 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
TtrP07309 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
TtrP07309 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
TtrP07309 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
TtrP07309 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
TtrP07309 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
TtrP07309 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
TtrP07309 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
TtrP07309 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
TtrP07309 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
TtrP07309 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
TtrP07309 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
TtrP07309 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
TtrP07309 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
TtrP07309 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
TtrP07309 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
TtrP07309 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
TtrP07309 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
TtrP07309 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
TtrP07309 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
TtrP07309 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
TtrP07309 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
TtrP07309 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
TtrP07309 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
TtrP07309 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
TtrP07309 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
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