Protein–RNA interactions for Protein: P06800

Ptprc, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, mousemouse

Predictions only

Length 1,291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PtprcP06800 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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PtprcP06800 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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PtprcP06800 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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PtprcP06800 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
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PtprcP06800 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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PtprcP06800 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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PtprcP06800 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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PtprcP06800 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PtprcP06800 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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PtprcP06800 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms