Protein–RNA interactions for Protein: P04342

Crygd, Gamma-crystallin D, mousemouse

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrygdP04342 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CrygdP04342 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CrygdP04342 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
CrygdP04342 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
CrygdP04342 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
CrygdP04342 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
CrygdP04342 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CrygdP04342 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
CrygdP04342 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
CrygdP04342 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
CrygdP04342 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
CrygdP04342 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
CrygdP04342 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
CrygdP04342 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
CrygdP04342 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
CrygdP04342 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
CrygdP04342 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
CrygdP04342 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
CrygdP04342 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
CrygdP04342 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
CrygdP04342 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CrygdP04342 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
CrygdP04342 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CrygdP04342 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
CrygdP04342 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CrygdP04342 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CrygdP04342 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CrygdP04342 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
CrygdP04342 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
CrygdP04342 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CrygdP04342 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CrygdP04342 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CrygdP04342 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CrygdP04342 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CrygdP04342 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CrygdP04342 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CrygdP04342 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CrygdP04342 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
CrygdP04342 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
CrygdP04342 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
CrygdP04342 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CrygdP04342 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CrygdP04342 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CrygdP04342 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
CrygdP04342 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
CrygdP04342 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CrygdP04342 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
CrygdP04342 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CrygdP04342 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
CrygdP04342 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CrygdP04342 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CrygdP04342 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CrygdP04342 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CrygdP04342 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CrygdP04342 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CrygdP04342 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CrygdP04342 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
CrygdP04342 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CrygdP04342 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CrygdP04342 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
CrygdP04342 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CrygdP04342 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CrygdP04342 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CrygdP04342 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CrygdP04342 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
CrygdP04342 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
CrygdP04342 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
CrygdP04342 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CrygdP04342 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CrygdP04342 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CrygdP04342 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CrygdP04342 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CrygdP04342 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CrygdP04342 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
CrygdP04342 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CrygdP04342 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CrygdP04342 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CrygdP04342 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CrygdP04342 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CrygdP04342 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CrygdP04342 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
CrygdP04342 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
CrygdP04342 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CrygdP04342 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
CrygdP04342 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CrygdP04342 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CrygdP04342 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CrygdP04342 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CrygdP04342 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
CrygdP04342 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CrygdP04342 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CrygdP04342 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CrygdP04342 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
CrygdP04342 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
CrygdP04342 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
CrygdP04342 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
CrygdP04342 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CrygdP04342 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
CrygdP04342 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
CrygdP04342 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms