Protein–RNA interactions for Protein: P04214

T-cell receptor beta chain V region E1, mousemouse

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Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04214 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P04214 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P04214 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P04214 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
P04214 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P04214 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P04214 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P04214 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
P04214 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
P04214 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
P04214 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P04214 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P04214 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P04214 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P04214 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P04214 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P04214 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P04214 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P04214 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P04214 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P04214 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P04214 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P04214 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P04214 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
P04214 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P04214 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
P04214 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P04214 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P04214 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
P04214 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P04214 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P04214 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P04214 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P04214 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P04214 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P04214 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P04214 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
P04214 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
P04214 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P04214 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P04214 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P04214 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P04214 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P04214 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P04214 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P04214 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P04214 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P04214 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P04214 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P04214 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P04214 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
P04214 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P04214 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P04214 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P04214 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P04214 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P04214 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
P04214 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
P04214 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P04214 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P04214 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
P04214 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P04214 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
P04214 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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P04214 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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P04214 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P04214 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P04214 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
P04214 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
P04214 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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P04214 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
P04214 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P04214 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
P04214 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P04214 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P04214 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P04214 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
P04214 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P04214 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P04214 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P04214 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
P04214 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
P04214 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P04214 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
P04214 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P04214 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
P04214 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
P04214 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
P04214 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
P04214 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
P04214 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
P04214 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
P04214 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
P04214 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
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