Protein–RNA interactions for Protein: P04202

Tgfb1, Transforming growth factor beta-1, mousemouse

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Length 390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb1P04202 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Tgfb1P04202 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tgfb1P04202 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
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Tgfb1P04202 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Tgfb1P04202 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tgfb1P04202 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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