Protein–RNA interactions for Protein: P00848

Mtatp6, ATP synthase subunit a, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtatp6P00848 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Mtatp6P00848 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Mtatp6P00848 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mtatp6P00848 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Mtatp6P00848 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mtatp6P00848 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mtatp6P00848 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mtatp6P00848 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mtatp6P00848 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mtatp6P00848 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mtatp6P00848 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Mtatp6P00848 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mtatp6P00848 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mtatp6P00848 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mtatp6P00848 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mtatp6P00848 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mtatp6P00848 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mtatp6P00848 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mtatp6P00848 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Mtatp6P00848 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mtatp6P00848 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mtatp6P00848 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mtatp6P00848 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mtatp6P00848 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mtatp6P00848 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mtatp6P00848 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mtatp6P00848 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mtatp6P00848 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mtatp6P00848 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mtatp6P00848 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mtatp6P00848 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Mtatp6P00848 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mtatp6P00848 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mtatp6P00848 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mtatp6P00848 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mtatp6P00848 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mtatp6P00848 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mtatp6P00848 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mtatp6P00848 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mtatp6P00848 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mtatp6P00848 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mtatp6P00848 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mtatp6P00848 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mtatp6P00848 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mtatp6P00848 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mtatp6P00848 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mtatp6P00848 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mtatp6P00848 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Mtatp6P00848 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mtatp6P00848 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Mtatp6P00848 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mtatp6P00848 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mtatp6P00848 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mtatp6P00848 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mtatp6P00848 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mtatp6P00848 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mtatp6P00848 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mtatp6P00848 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mtatp6P00848 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mtatp6P00848 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Mtatp6P00848 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mtatp6P00848 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mtatp6P00848 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mtatp6P00848 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mtatp6P00848 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mtatp6P00848 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mtatp6P00848 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mtatp6P00848 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mtatp6P00848 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mtatp6P00848 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mtatp6P00848 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mtatp6P00848 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mtatp6P00848 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mtatp6P00848 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mtatp6P00848 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mtatp6P00848 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mtatp6P00848 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mtatp6P00848 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Mtatp6P00848 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mtatp6P00848 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mtatp6P00848 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mtatp6P00848 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Mtatp6P00848 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mtatp6P00848 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mtatp6P00848 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Mtatp6P00848 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mtatp6P00848 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mtatp6P00848 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mtatp6P00848 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mtatp6P00848 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mtatp6P00848 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mtatp6P00848 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mtatp6P00848 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mtatp6P00848 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mtatp6P00848 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mtatp6P00848 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Mtatp6P00848 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mtatp6P00848 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mtatp6P00848 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Mtatp6P00848 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.2 ms