Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccl20O89093 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccl20O89093 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccl20O89093 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccl20O89093 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccl20O89093 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccl20O89093 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccl20O89093 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccl20O89093 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccl20O89093 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccl20O89093 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccl20O89093 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccl20O89093 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccl20O89093 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccl20O89093 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccl20O89093 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccl20O89093 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccl20O89093 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccl20O89093 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccl20O89093 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccl20O89093 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccl20O89093 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccl20O89093 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccl20O89093 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccl20O89093 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccl20O89093 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccl20O89093 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ccl20O89093 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccl20O89093 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccl20O89093 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccl20O89093 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccl20O89093 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccl20O89093 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccl20O89093 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccl20O89093 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccl20O89093 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccl20O89093 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccl20O89093 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccl20O89093 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccl20O89093 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccl20O89093 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccl20O89093 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccl20O89093 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccl20O89093 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccl20O89093 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccl20O89093 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccl20O89093 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccl20O89093 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccl20O89093 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccl20O89093 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccl20O89093 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccl20O89093 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccl20O89093 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccl20O89093 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccl20O89093 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccl20O89093 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccl20O89093 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccl20O89093 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccl20O89093 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccl20O89093 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccl20O89093 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccl20O89093 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccl20O89093 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccl20O89093 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccl20O89093 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccl20O89093 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccl20O89093 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccl20O89093 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccl20O89093 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Ccl20O89093 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccl20O89093 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccl20O89093 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccl20O89093 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccl20O89093 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccl20O89093 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccl20O89093 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccl20O89093 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccl20O89093 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccl20O89093 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccl20O89093 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccl20O89093 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccl20O89093 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccl20O89093 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccl20O89093 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccl20O89093 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccl20O89093 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccl20O89093 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccl20O89093 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccl20O89093 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccl20O89093 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccl20O89093 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccl20O89093 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccl20O89093 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccl20O89093 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccl20O89093 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccl20O89093 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccl20O89093 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccl20O89093 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccl20O89093 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Ccl20O89093 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
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