Protein–RNA interactions for Protein: O88809

Dcx, Neuronal migration protein doublecortin, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DcxO88809 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DcxO88809 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DcxO88809 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DcxO88809 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DcxO88809 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DcxO88809 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
DcxO88809 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DcxO88809 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DcxO88809 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DcxO88809 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DcxO88809 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DcxO88809 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DcxO88809 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DcxO88809 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
DcxO88809 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DcxO88809 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DcxO88809 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DcxO88809 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DcxO88809 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DcxO88809 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DcxO88809 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DcxO88809 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
DcxO88809 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DcxO88809 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DcxO88809 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DcxO88809 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DcxO88809 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DcxO88809 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DcxO88809 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DcxO88809 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DcxO88809 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DcxO88809 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DcxO88809 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DcxO88809 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DcxO88809 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DcxO88809 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
DcxO88809 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
DcxO88809 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
DcxO88809 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DcxO88809 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DcxO88809 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DcxO88809 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DcxO88809 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DcxO88809 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DcxO88809 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DcxO88809 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
DcxO88809 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DcxO88809 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DcxO88809 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DcxO88809 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DcxO88809 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DcxO88809 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DcxO88809 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DcxO88809 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DcxO88809 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
DcxO88809 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DcxO88809 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
DcxO88809 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DcxO88809 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DcxO88809 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DcxO88809 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DcxO88809 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DcxO88809 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DcxO88809 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DcxO88809 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DcxO88809 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DcxO88809 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DcxO88809 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DcxO88809 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DcxO88809 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DcxO88809 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DcxO88809 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DcxO88809 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DcxO88809 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DcxO88809 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DcxO88809 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DcxO88809 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DcxO88809 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
DcxO88809 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
DcxO88809 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
DcxO88809 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DcxO88809 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DcxO88809 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DcxO88809 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DcxO88809 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DcxO88809 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DcxO88809 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DcxO88809 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DcxO88809 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DcxO88809 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DcxO88809 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
DcxO88809 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DcxO88809 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DcxO88809 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
DcxO88809 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DcxO88809 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DcxO88809 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DcxO88809 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
DcxO88809 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
DcxO88809 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms