Protein–RNA interactions for Protein: O88520

Shoc2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shoc2O88520 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Shoc2O88520 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Shoc2O88520 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Shoc2O88520 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Shoc2O88520 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Shoc2O88520 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Shoc2O88520 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Shoc2O88520 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Shoc2O88520 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Shoc2O88520 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Shoc2O88520 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Shoc2O88520 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Shoc2O88520 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Shoc2O88520 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Shoc2O88520 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Shoc2O88520 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Shoc2O88520 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shoc2O88520 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shoc2O88520 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shoc2O88520 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shoc2O88520 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shoc2O88520 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shoc2O88520 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Shoc2O88520 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shoc2O88520 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shoc2O88520 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Shoc2O88520 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Shoc2O88520 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shoc2O88520 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shoc2O88520 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shoc2O88520 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Shoc2O88520 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shoc2O88520 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shoc2O88520 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shoc2O88520 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shoc2O88520 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shoc2O88520 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Shoc2O88520 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shoc2O88520 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shoc2O88520 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shoc2O88520 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shoc2O88520 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shoc2O88520 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shoc2O88520 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shoc2O88520 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shoc2O88520 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shoc2O88520 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shoc2O88520 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Shoc2O88520 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shoc2O88520 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shoc2O88520 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Shoc2O88520 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shoc2O88520 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shoc2O88520 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shoc2O88520 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shoc2O88520 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shoc2O88520 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shoc2O88520 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Shoc2O88520 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Shoc2O88520 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Shoc2O88520 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Shoc2O88520 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Shoc2O88520 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Shoc2O88520 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Shoc2O88520 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Shoc2O88520 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Shoc2O88520 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shoc2O88520 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shoc2O88520 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shoc2O88520 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Shoc2O88520 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Shoc2O88520 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Shoc2O88520 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Shoc2O88520 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Shoc2O88520 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Shoc2O88520 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Shoc2O88520 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Shoc2O88520 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Shoc2O88520 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Shoc2O88520 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Shoc2O88520 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Shoc2O88520 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Shoc2O88520 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Shoc2O88520 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Shoc2O88520 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Shoc2O88520 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Shoc2O88520 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Shoc2O88520 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Shoc2O88520 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Shoc2O88520 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Shoc2O88520 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Shoc2O88520 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Shoc2O88520 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Shoc2O88520 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Shoc2O88520 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shoc2O88520 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shoc2O88520 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shoc2O88520 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shoc2O88520 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Shoc2O88520 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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