Protein–RNA interactions for Protein: O70491

Stra6, Receptor for retinol uptake STRA6, mousemouse

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Length 670 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stra6O70491 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Stra6O70491 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stra6O70491 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Stra6O70491 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stra6O70491 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Stra6O70491 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stra6O70491 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stra6O70491 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stra6O70491 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stra6O70491 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stra6O70491 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stra6O70491 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Stra6O70491 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stra6O70491 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stra6O70491 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stra6O70491 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stra6O70491 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stra6O70491 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stra6O70491 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stra6O70491 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stra6O70491 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stra6O70491 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stra6O70491 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stra6O70491 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Stra6O70491 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stra6O70491 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stra6O70491 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stra6O70491 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stra6O70491 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stra6O70491 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stra6O70491 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stra6O70491 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stra6O70491 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stra6O70491 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stra6O70491 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stra6O70491 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stra6O70491 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stra6O70491 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stra6O70491 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stra6O70491 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Stra6O70491 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stra6O70491 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stra6O70491 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stra6O70491 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stra6O70491 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Stra6O70491 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Stra6O70491 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Stra6O70491 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Stra6O70491 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Stra6O70491 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Stra6O70491 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Stra6O70491 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Stra6O70491 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Stra6O70491 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stra6O70491 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stra6O70491 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stra6O70491 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stra6O70491 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stra6O70491 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stra6O70491 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stra6O70491 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stra6O70491 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stra6O70491 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stra6O70491 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stra6O70491 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Stra6O70491 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stra6O70491 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stra6O70491 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Stra6O70491 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stra6O70491 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Stra6O70491 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stra6O70491 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stra6O70491 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stra6O70491 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stra6O70491 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stra6O70491 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stra6O70491 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stra6O70491 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stra6O70491 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stra6O70491 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stra6O70491 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stra6O70491 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stra6O70491 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stra6O70491 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Stra6O70491 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stra6O70491 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stra6O70491 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stra6O70491 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stra6O70491 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stra6O70491 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stra6O70491 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stra6O70491 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stra6O70491 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stra6O70491 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stra6O70491 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stra6O70491 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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