Protein–RNA interactions for Protein: O55187

Cbx4, E3 SUMO-protein ligase CBX4, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx4O55187 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms