Protein–RNA interactions for Protein: O55028

Bckdk, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdkO55028 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
BckdkO55028 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
BckdkO55028 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
BckdkO55028 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
BckdkO55028 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
BckdkO55028 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
BckdkO55028 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
BckdkO55028 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
BckdkO55028 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
BckdkO55028 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
BckdkO55028 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
BckdkO55028 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
BckdkO55028 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
BckdkO55028 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
BckdkO55028 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
BckdkO55028 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
BckdkO55028 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
BckdkO55028 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
BckdkO55028 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
BckdkO55028 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
BckdkO55028 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
BckdkO55028 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
BckdkO55028 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
BckdkO55028 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
BckdkO55028 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
BckdkO55028 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
BckdkO55028 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
BckdkO55028 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
BckdkO55028 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
BckdkO55028 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
BckdkO55028 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
BckdkO55028 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
BckdkO55028 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
BckdkO55028 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
BckdkO55028 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
BckdkO55028 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
BckdkO55028 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
BckdkO55028 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
BckdkO55028 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
BckdkO55028 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
BckdkO55028 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
BckdkO55028 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
BckdkO55028 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
BckdkO55028 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
BckdkO55028 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
BckdkO55028 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
BckdkO55028 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
BckdkO55028 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
BckdkO55028 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
BckdkO55028 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
BckdkO55028 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
BckdkO55028 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
BckdkO55028 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
BckdkO55028 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
BckdkO55028 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
BckdkO55028 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
BckdkO55028 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
BckdkO55028 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
BckdkO55028 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
BckdkO55028 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
BckdkO55028 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
BckdkO55028 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
BckdkO55028 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
BckdkO55028 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
BckdkO55028 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
BckdkO55028 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
BckdkO55028 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
BckdkO55028 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
BckdkO55028 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
BckdkO55028 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
BckdkO55028 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
BckdkO55028 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
BckdkO55028 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
BckdkO55028 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
BckdkO55028 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
BckdkO55028 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
BckdkO55028 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
BckdkO55028 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
BckdkO55028 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
BckdkO55028 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
BckdkO55028 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
BckdkO55028 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
BckdkO55028 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
BckdkO55028 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
BckdkO55028 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
BckdkO55028 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
BckdkO55028 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
BckdkO55028 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
BckdkO55028 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
BckdkO55028 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
BckdkO55028 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
BckdkO55028 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
BckdkO55028 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
BckdkO55028 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
BckdkO55028 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
BckdkO55028 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BckdkO55028 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
BckdkO55028 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BckdkO55028 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
BckdkO55028 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms