Protein–RNA interactions for Protein: O54988

Slk, STE20-like serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlkO54988 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SlkO54988 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SlkO54988 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SlkO54988 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SlkO54988 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SlkO54988 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SlkO54988 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SlkO54988 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SlkO54988 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SlkO54988 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SlkO54988 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SlkO54988 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SlkO54988 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SlkO54988 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SlkO54988 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SlkO54988 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SlkO54988 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SlkO54988 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SlkO54988 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SlkO54988 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SlkO54988 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SlkO54988 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SlkO54988 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SlkO54988 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SlkO54988 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SlkO54988 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SlkO54988 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SlkO54988 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SlkO54988 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SlkO54988 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SlkO54988 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SlkO54988 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SlkO54988 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SlkO54988 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SlkO54988 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SlkO54988 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SlkO54988 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SlkO54988 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SlkO54988 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SlkO54988 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SlkO54988 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SlkO54988 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SlkO54988 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SlkO54988 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SlkO54988 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SlkO54988 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SlkO54988 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SlkO54988 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SlkO54988 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SlkO54988 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SlkO54988 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SlkO54988 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SlkO54988 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SlkO54988 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SlkO54988 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SlkO54988 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SlkO54988 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SlkO54988 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SlkO54988 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SlkO54988 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SlkO54988 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SlkO54988 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SlkO54988 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SlkO54988 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SlkO54988 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SlkO54988 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SlkO54988 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SlkO54988 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SlkO54988 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SlkO54988 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SlkO54988 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SlkO54988 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SlkO54988 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SlkO54988 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SlkO54988 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SlkO54988 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SlkO54988 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SlkO54988 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SlkO54988 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SlkO54988 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SlkO54988 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SlkO54988 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SlkO54988 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SlkO54988 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SlkO54988 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SlkO54988 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SlkO54988 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SlkO54988 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SlkO54988 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SlkO54988 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SlkO54988 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SlkO54988 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SlkO54988 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SlkO54988 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SlkO54988 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SlkO54988 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SlkO54988 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SlkO54988 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SlkO54988 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SlkO54988 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms