Protein–RNA interactions for Protein: O54910

Nfkbie, NF-kappa-B inhibitor epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfkbieO54910 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NfkbieO54910 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NfkbieO54910 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NfkbieO54910 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NfkbieO54910 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NfkbieO54910 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NfkbieO54910 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
NfkbieO54910 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NfkbieO54910 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NfkbieO54910 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NfkbieO54910 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NfkbieO54910 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NfkbieO54910 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NfkbieO54910 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NfkbieO54910 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NfkbieO54910 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NfkbieO54910 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NfkbieO54910 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NfkbieO54910 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NfkbieO54910 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NfkbieO54910 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NfkbieO54910 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NfkbieO54910 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NfkbieO54910 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NfkbieO54910 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
NfkbieO54910 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
NfkbieO54910 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NfkbieO54910 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NfkbieO54910 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NfkbieO54910 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NfkbieO54910 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NfkbieO54910 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NfkbieO54910 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NfkbieO54910 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NfkbieO54910 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NfkbieO54910 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NfkbieO54910 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NfkbieO54910 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NfkbieO54910 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NfkbieO54910 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NfkbieO54910 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
NfkbieO54910 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
NfkbieO54910 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
NfkbieO54910 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NfkbieO54910 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NfkbieO54910 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
NfkbieO54910 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NfkbieO54910 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NfkbieO54910 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
NfkbieO54910 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NfkbieO54910 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NfkbieO54910 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NfkbieO54910 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NfkbieO54910 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NfkbieO54910 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NfkbieO54910 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NfkbieO54910 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
NfkbieO54910 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
NfkbieO54910 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NfkbieO54910 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NfkbieO54910 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NfkbieO54910 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NfkbieO54910 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NfkbieO54910 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NfkbieO54910 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NfkbieO54910 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NfkbieO54910 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NfkbieO54910 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NfkbieO54910 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NfkbieO54910 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NfkbieO54910 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NfkbieO54910 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NfkbieO54910 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NfkbieO54910 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
NfkbieO54910 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NfkbieO54910 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NfkbieO54910 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
NfkbieO54910 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
NfkbieO54910 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NfkbieO54910 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NfkbieO54910 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NfkbieO54910 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NfkbieO54910 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NfkbieO54910 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NfkbieO54910 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NfkbieO54910 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NfkbieO54910 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NfkbieO54910 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NfkbieO54910 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
NfkbieO54910 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
NfkbieO54910 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NfkbieO54910 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NfkbieO54910 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NfkbieO54910 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NfkbieO54910 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NfkbieO54910 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NfkbieO54910 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NfkbieO54910 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NfkbieO54910 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NfkbieO54910 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms