Protein–RNA interactions for Protein: O35638

Stag2, Cohesin subunit SA-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stag2O35638 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Stag2O35638 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stag2O35638 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stag2O35638 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stag2O35638 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Stag2O35638 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stag2O35638 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stag2O35638 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stag2O35638 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stag2O35638 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Stag2O35638 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stag2O35638 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stag2O35638 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stag2O35638 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stag2O35638 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stag2O35638 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stag2O35638 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stag2O35638 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stag2O35638 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stag2O35638 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stag2O35638 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stag2O35638 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stag2O35638 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stag2O35638 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stag2O35638 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stag2O35638 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Stag2O35638 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stag2O35638 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stag2O35638 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stag2O35638 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stag2O35638 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stag2O35638 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stag2O35638 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Stag2O35638 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stag2O35638 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stag2O35638 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Stag2O35638 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stag2O35638 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stag2O35638 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Stag2O35638 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stag2O35638 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stag2O35638 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stag2O35638 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stag2O35638 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stag2O35638 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stag2O35638 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stag2O35638 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stag2O35638 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stag2O35638 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stag2O35638 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stag2O35638 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stag2O35638 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stag2O35638 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stag2O35638 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Stag2O35638 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Stag2O35638 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Stag2O35638 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stag2O35638 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stag2O35638 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stag2O35638 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stag2O35638 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stag2O35638 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stag2O35638 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stag2O35638 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stag2O35638 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Stag2O35638 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Stag2O35638 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stag2O35638 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stag2O35638 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stag2O35638 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stag2O35638 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stag2O35638 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stag2O35638 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stag2O35638 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stag2O35638 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stag2O35638 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stag2O35638 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stag2O35638 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stag2O35638 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stag2O35638 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stag2O35638 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Stag2O35638 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Stag2O35638 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stag2O35638 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stag2O35638 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stag2O35638 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stag2O35638 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stag2O35638 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stag2O35638 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stag2O35638 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stag2O35638 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stag2O35638 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stag2O35638 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stag2O35638 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stag2O35638 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stag2O35638 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stag2O35638 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stag2O35638 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stag2O35638 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Stag2O35638 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms