Protein–RNA interactions for Protein: O35449

Prrt1, Proline-rich transmembrane protein 1, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt1O35449 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Prrt1O35449 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Prrt1O35449 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Prrt1O35449 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Prrt1O35449 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Prrt1O35449 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Prrt1O35449 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Prrt1O35449 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Prrt1O35449 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Prrt1O35449 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Prrt1O35449 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Prrt1O35449 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Prrt1O35449 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Prrt1O35449 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Prrt1O35449 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Prrt1O35449 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Prrt1O35449 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Prrt1O35449 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Prrt1O35449 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Prrt1O35449 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Prrt1O35449 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Prrt1O35449 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Prrt1O35449 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Prrt1O35449 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Prrt1O35449 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Prrt1O35449 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Prrt1O35449 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Prrt1O35449 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Prrt1O35449 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Prrt1O35449 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Prrt1O35449 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Prrt1O35449 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Prrt1O35449 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Prrt1O35449 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Prrt1O35449 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Prrt1O35449 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Prrt1O35449 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Prrt1O35449 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Prrt1O35449 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Prrt1O35449 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Prrt1O35449 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Prrt1O35449 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Prrt1O35449 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Prrt1O35449 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
Prrt1O35449 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Prrt1O35449 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Prrt1O35449 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Prrt1O35449 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Prrt1O35449 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Prrt1O35449 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Prrt1O35449 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Prrt1O35449 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Prrt1O35449 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Prrt1O35449 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Prrt1O35449 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Prrt1O35449 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Prrt1O35449 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Prrt1O35449 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Prrt1O35449 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Prrt1O35449 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Prrt1O35449 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Prrt1O35449 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Prrt1O35449 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Prrt1O35449 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Prrt1O35449 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Prrt1O35449 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Prrt1O35449 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Prrt1O35449 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Prrt1O35449 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Prrt1O35449 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Prrt1O35449 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Prrt1O35449 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
Prrt1O35449 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Prrt1O35449 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Prrt1O35449 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Prrt1O35449 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Prrt1O35449 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Prrt1O35449 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Prrt1O35449 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Prrt1O35449 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Prrt1O35449 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Prrt1O35449 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Prrt1O35449 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Prrt1O35449 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Prrt1O35449 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Prrt1O35449 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Prrt1O35449 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Prrt1O35449 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Prrt1O35449 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Prrt1O35449 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Prrt1O35449 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Prrt1O35449 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Prrt1O35449 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Prrt1O35449 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Prrt1O35449 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Prrt1O35449 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Prrt1O35449 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Prrt1O35449 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Prrt1O35449 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Prrt1O35449 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
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