Protein–RNA interactions for Protein: O35245

Pkd2, Polycystin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2O35245 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pkd2O35245 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pkd2O35245 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pkd2O35245 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pkd2O35245 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pkd2O35245 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pkd2O35245 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Pkd2O35245 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pkd2O35245 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pkd2O35245 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pkd2O35245 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pkd2O35245 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pkd2O35245 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pkd2O35245 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pkd2O35245 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pkd2O35245 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pkd2O35245 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pkd2O35245 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pkd2O35245 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Pkd2O35245 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pkd2O35245 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pkd2O35245 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pkd2O35245 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pkd2O35245 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pkd2O35245 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pkd2O35245 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pkd2O35245 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pkd2O35245 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pkd2O35245 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pkd2O35245 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pkd2O35245 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pkd2O35245 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pkd2O35245 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pkd2O35245 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pkd2O35245 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pkd2O35245 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pkd2O35245 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pkd2O35245 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pkd2O35245 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pkd2O35245 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pkd2O35245 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pkd2O35245 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pkd2O35245 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pkd2O35245 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pkd2O35245 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pkd2O35245 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pkd2O35245 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pkd2O35245 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pkd2O35245 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pkd2O35245 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pkd2O35245 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pkd2O35245 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Pkd2O35245 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Pkd2O35245 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Pkd2O35245 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pkd2O35245 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pkd2O35245 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pkd2O35245 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pkd2O35245 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pkd2O35245 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pkd2O35245 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pkd2O35245 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pkd2O35245 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pkd2O35245 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pkd2O35245 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pkd2O35245 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Pkd2O35245 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pkd2O35245 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pkd2O35245 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pkd2O35245 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pkd2O35245 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pkd2O35245 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pkd2O35245 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pkd2O35245 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Pkd2O35245 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pkd2O35245 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pkd2O35245 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pkd2O35245 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pkd2O35245 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pkd2O35245 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pkd2O35245 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pkd2O35245 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pkd2O35245 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pkd2O35245 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pkd2O35245 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pkd2O35245 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pkd2O35245 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pkd2O35245 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pkd2O35245 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pkd2O35245 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pkd2O35245 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pkd2O35245 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pkd2O35245 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pkd2O35245 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pkd2O35245 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pkd2O35245 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pkd2O35245 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pkd2O35245 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pkd2O35245 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pkd2O35245 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms