Protein–RNA interactions for Protein: O35085

Arx, Homeobox protein ARX, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArxO35085 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ArxO35085 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ArxO35085 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ArxO35085 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ArxO35085 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ArxO35085 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ArxO35085 Ddah1-202ENSMUST00000120310 2291 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ArxO35085 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ArxO35085 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ArxO35085 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ArxO35085 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ArxO35085 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ArxO35085 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ArxO35085 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ArxO35085 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ArxO35085 Pitpnm2os2-203ENSMUST00000198466 2467 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ArxO35085 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ArxO35085 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ArxO35085 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ArxO35085 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ArxO35085 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ArxO35085 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ArxO35085 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
ArxO35085 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ArxO35085 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ArxO35085 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ArxO35085 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ArxO35085 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ArxO35085 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ArxO35085 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ArxO35085 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ArxO35085 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ArxO35085 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
ArxO35085 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ArxO35085 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ArxO35085 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ArxO35085 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ArxO35085 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
ArxO35085 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ArxO35085 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ArxO35085 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ArxO35085 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ArxO35085 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ArxO35085 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ArxO35085 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ArxO35085 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ArxO35085 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ArxO35085 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ArxO35085 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ArxO35085 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ArxO35085 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ArxO35085 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ArxO35085 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ArxO35085 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ArxO35085 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ArxO35085 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ArxO35085 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ArxO35085 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ArxO35085 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ArxO35085 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ArxO35085 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ArxO35085 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ArxO35085 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ArxO35085 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ArxO35085 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ArxO35085 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ArxO35085 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ArxO35085 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ArxO35085 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ArxO35085 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ArxO35085 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ArxO35085 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ArxO35085 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ArxO35085 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ArxO35085 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ArxO35085 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ArxO35085 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ArxO35085 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ArxO35085 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ArxO35085 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ArxO35085 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ArxO35085 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ArxO35085 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ArxO35085 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ArxO35085 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ArxO35085 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ArxO35085 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ArxO35085 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ArxO35085 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ArxO35085 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ArxO35085 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ArxO35085 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ArxO35085 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ArxO35085 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ArxO35085 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ArxO35085 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ArxO35085 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ArxO35085 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ArxO35085 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ArxO35085 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms