Protein–RNA interactions for Protein: O08999

Ltbp2, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,813 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ltbp2O08999 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ltbp2O08999 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ltbp2O08999 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ltbp2O08999 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ltbp2O08999 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ltbp2O08999 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ltbp2O08999 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Ltbp2O08999 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Ltbp2O08999 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ltbp2O08999 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ltbp2O08999 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Ltbp2O08999 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ltbp2O08999 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Ltbp2O08999 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Ltbp2O08999 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ltbp2O08999 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Ltbp2O08999 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ltbp2O08999 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Ltbp2O08999 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Ltbp2O08999 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ltbp2O08999 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ltbp2O08999 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ltbp2O08999 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ltbp2O08999 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Ltbp2O08999 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ltbp2O08999 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ltbp2O08999 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ltbp2O08999 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Ltbp2O08999 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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