Protein–RNA interactions for Protein: L7N2D9

Gm3239, Predicted gene 3239, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3239L7N2D9 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3239L7N2D9 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3239L7N2D9 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3239L7N2D9 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3239L7N2D9 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3239L7N2D9 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3239L7N2D9 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3239L7N2D9 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3239L7N2D9 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3239L7N2D9 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3239L7N2D9 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3239L7N2D9 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3239L7N2D9 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3239L7N2D9 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3239L7N2D9 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3239L7N2D9 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3239L7N2D9 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3239L7N2D9 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3239L7N2D9 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3239L7N2D9 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3239L7N2D9 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3239L7N2D9 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3239L7N2D9 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3239L7N2D9 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3239L7N2D9 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3239L7N2D9 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3239L7N2D9 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gm3239L7N2D9 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm3239L7N2D9 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm3239L7N2D9 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm3239L7N2D9 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm3239L7N2D9 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm3239L7N2D9 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm3239L7N2D9 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm3239L7N2D9 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm3239L7N2D9 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Gm3239L7N2D9 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm3239L7N2D9 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm3239L7N2D9 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm3239L7N2D9 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm3239L7N2D9 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm3239L7N2D9 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm3239L7N2D9 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm3239L7N2D9 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm3239L7N2D9 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm3239L7N2D9 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm3239L7N2D9 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm3239L7N2D9 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm3239L7N2D9 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm3239L7N2D9 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm3239L7N2D9 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm3239L7N2D9 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm3239L7N2D9 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm3239L7N2D9 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm3239L7N2D9 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm3239L7N2D9 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm3239L7N2D9 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm3239L7N2D9 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm3239L7N2D9 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm3239L7N2D9 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm3239L7N2D9 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm3239L7N2D9 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm3239L7N2D9 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3239L7N2D9 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3239L7N2D9 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3239L7N2D9 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3239L7N2D9 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3239L7N2D9 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3239L7N2D9 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3239L7N2D9 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3239L7N2D9 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3239L7N2D9 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3239L7N2D9 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3239L7N2D9 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3239L7N2D9 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3239L7N2D9 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3239L7N2D9 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3239L7N2D9 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3239L7N2D9 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3239L7N2D9 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3239L7N2D9 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3239L7N2D9 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3239L7N2D9 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3239L7N2D9 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3239L7N2D9 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3239L7N2D9 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3239L7N2D9 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3239L7N2D9 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3239L7N2D9 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3239L7N2D9 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3239L7N2D9 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3239L7N2D9 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3239L7N2D9 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3239L7N2D9 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3239L7N2D9 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3239L7N2D9 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3239L7N2D9 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3239L7N2D9 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3239L7N2D9 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm3239L7N2D9 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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