Protein–RNA interactions for Protein: L7N2D2

Gm3278, Predicted gene 3278, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3278L7N2D2 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3278L7N2D2 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3278L7N2D2 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3278L7N2D2 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3278L7N2D2 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3278L7N2D2 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3278L7N2D2 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3278L7N2D2 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3278L7N2D2 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3278L7N2D2 Gm5441-202ENSMUST00000190132 449 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3278L7N2D2 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3278L7N2D2 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3278L7N2D2 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3278L7N2D2 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3278L7N2D2 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3278L7N2D2 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3278L7N2D2 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3278L7N2D2 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3278L7N2D2 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3278L7N2D2 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3278L7N2D2 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3278L7N2D2 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3278L7N2D2 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3278L7N2D2 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3278L7N2D2 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3278L7N2D2 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3278L7N2D2 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3278L7N2D2 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3278L7N2D2 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm3278L7N2D2 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3278L7N2D2 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3278L7N2D2 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3278L7N2D2 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3278L7N2D2 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3278L7N2D2 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3278L7N2D2 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3278L7N2D2 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3278L7N2D2 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3278L7N2D2 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3278L7N2D2 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3278L7N2D2 Gm15501-201ENSMUST00000133910 849 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3278L7N2D2 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3278L7N2D2 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3278L7N2D2 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3278L7N2D2 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3278L7N2D2 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3278L7N2D2 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3278L7N2D2 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3278L7N2D2 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3278L7N2D2 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3278L7N2D2 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3278L7N2D2 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3278L7N2D2 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3278L7N2D2 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3278L7N2D2 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3278L7N2D2 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3278L7N2D2 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3278L7N2D2 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3278L7N2D2 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3278L7N2D2 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3278L7N2D2 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3278L7N2D2 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3278L7N2D2 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3278L7N2D2 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3278L7N2D2 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3278L7N2D2 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3278L7N2D2 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm3278L7N2D2 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm3278L7N2D2 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm3278L7N2D2 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm3278L7N2D2 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm3278L7N2D2 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm3278L7N2D2 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm3278L7N2D2 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm3278L7N2D2 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm3278L7N2D2 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm3278L7N2D2 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm3278L7N2D2 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm3278L7N2D2 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm3278L7N2D2 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm3278L7N2D2 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm3278L7N2D2 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm3278L7N2D2 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm3278L7N2D2 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm3278L7N2D2 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm3278L7N2D2 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm3278L7N2D2 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm3278L7N2D2 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm3278L7N2D2 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm3278L7N2D2 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm3278L7N2D2 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm3278L7N2D2 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm3278L7N2D2 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm3278L7N2D2 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm3278L7N2D2 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm3278L7N2D2 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm3278L7N2D2 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3278L7N2D2 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3278L7N2D2 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3278L7N2D2 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms