Protein–RNA interactions for Protein: J3QPX5

Gm8888, Predicted gene 8888, mousemouse

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8888J3QPX5 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm8888J3QPX5 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm8888J3QPX5 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm8888J3QPX5 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm8888J3QPX5 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm8888J3QPX5 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm8888J3QPX5 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm8888J3QPX5 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm8888J3QPX5 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm8888J3QPX5 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm8888J3QPX5 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm8888J3QPX5 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm8888J3QPX5 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm8888J3QPX5 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm8888J3QPX5 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm8888J3QPX5 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm8888J3QPX5 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Gm8888J3QPX5 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm8888J3QPX5 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm8888J3QPX5 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm8888J3QPX5 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm8888J3QPX5 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm8888J3QPX5 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm8888J3QPX5 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm8888J3QPX5 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm8888J3QPX5 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm8888J3QPX5 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm8888J3QPX5 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm8888J3QPX5 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm8888J3QPX5 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Gm8888J3QPX5 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm8888J3QPX5 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm8888J3QPX5 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm8888J3QPX5 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm8888J3QPX5 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm8888J3QPX5 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm8888J3QPX5 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm8888J3QPX5 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm8888J3QPX5 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm8888J3QPX5 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm8888J3QPX5 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm8888J3QPX5 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm8888J3QPX5 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm8888J3QPX5 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm8888J3QPX5 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm8888J3QPX5 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm8888J3QPX5 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm8888J3QPX5 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm8888J3QPX5 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm8888J3QPX5 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm8888J3QPX5 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm8888J3QPX5 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm8888J3QPX5 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm8888J3QPX5 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm8888J3QPX5 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm8888J3QPX5 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm8888J3QPX5 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm8888J3QPX5 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm8888J3QPX5 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm8888J3QPX5 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm8888J3QPX5 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm8888J3QPX5 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm8888J3QPX5 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm8888J3QPX5 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm8888J3QPX5 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Gm8888J3QPX5 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm8888J3QPX5 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm8888J3QPX5 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm8888J3QPX5 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm8888J3QPX5 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm8888J3QPX5 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm8888J3QPX5 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm8888J3QPX5 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm8888J3QPX5 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm8888J3QPX5 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm8888J3QPX5 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm8888J3QPX5 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm8888J3QPX5 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm8888J3QPX5 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm8888J3QPX5 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm8888J3QPX5 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm8888J3QPX5 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm8888J3QPX5 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm8888J3QPX5 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm8888J3QPX5 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm8888J3QPX5 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm8888J3QPX5 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm8888J3QPX5 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm8888J3QPX5 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm8888J3QPX5 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm8888J3QPX5 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm8888J3QPX5 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm8888J3QPX5 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm8888J3QPX5 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm8888J3QPX5 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm8888J3QPX5 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm8888J3QPX5 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm8888J3QPX5 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm8888J3QPX5 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Gm8888J3QPX5 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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