Protein–RNA interactions for Protein: J3QN17

Gm20918, Predicted gene, 20918, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20918J3QN17 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20918J3QN17 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20918J3QN17 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20918J3QN17 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20918J3QN17 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20918J3QN17 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20918J3QN17 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm20918J3QN17 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Gm20918J3QN17 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm20918J3QN17 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm20918J3QN17 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm20918J3QN17 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm20918J3QN17 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Gm20918J3QN17 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Gm20918J3QN17 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm20918J3QN17 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm20918J3QN17 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm20918J3QN17 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Gm20918J3QN17 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20918J3QN17 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20918J3QN17 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Gm20918J3QN17 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Gm20918J3QN17 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20918J3QN17 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20918J3QN17 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20918J3QN17 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20918J3QN17 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20918J3QN17 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20918J3QN17 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20918J3QN17 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20918J3QN17 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20918J3QN17 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm20918J3QN17 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20918J3QN17 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20918J3QN17 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20918J3QN17 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20918J3QN17 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20918J3QN17 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20918J3QN17 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20918J3QN17 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20918J3QN17 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20918J3QN17 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20918J3QN17 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20918J3QN17 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20918J3QN17 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20918J3QN17 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20918J3QN17 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20918J3QN17 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20918J3QN17 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20918J3QN17 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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