Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS7

Gm11236, Predicted gene 11236, mousemouse

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Length 360 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm11236J3QMS7 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm11236J3QMS7 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm11236J3QMS7 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm11236J3QMS7 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm11236J3QMS7 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm11236J3QMS7 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm11236J3QMS7 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm11236J3QMS7 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm11236J3QMS7 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm11236J3QMS7 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm11236J3QMS7 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm11236J3QMS7 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm11236J3QMS7 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm11236J3QMS7 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm11236J3QMS7 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm11236J3QMS7 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm11236J3QMS7 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Gm11236J3QMS7 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm11236J3QMS7 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm11236J3QMS7 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm11236J3QMS7 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm11236J3QMS7 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm11236J3QMS7 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm11236J3QMS7 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm11236J3QMS7 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm11236J3QMS7 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm11236J3QMS7 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm11236J3QMS7 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm11236J3QMS7 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm11236J3QMS7 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm11236J3QMS7 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm11236J3QMS7 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm11236J3QMS7 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm11236J3QMS7 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm11236J3QMS7 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm11236J3QMS7 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm11236J3QMS7 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm11236J3QMS7 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm11236J3QMS7 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm11236J3QMS7 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm11236J3QMS7 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm11236J3QMS7 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm11236J3QMS7 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm11236J3QMS7 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm11236J3QMS7 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm11236J3QMS7 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm11236J3QMS7 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm11236J3QMS7 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gm11236J3QMS7 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm11236J3QMS7 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm11236J3QMS7 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm11236J3QMS7 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm11236J3QMS7 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm11236J3QMS7 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm11236J3QMS7 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm11236J3QMS7 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm11236J3QMS7 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm11236J3QMS7 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm11236J3QMS7 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm11236J3QMS7 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm11236J3QMS7 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm11236J3QMS7 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm11236J3QMS7 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm11236J3QMS7 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm11236J3QMS7 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm11236J3QMS7 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm11236J3QMS7 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm11236J3QMS7 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm11236J3QMS7 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm11236J3QMS7 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm11236J3QMS7 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm11236J3QMS7 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm11236J3QMS7 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm11236J3QMS7 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm11236J3QMS7 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm11236J3QMS7 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm11236J3QMS7 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm11236J3QMS7 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm11236J3QMS7 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm11236J3QMS7 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm11236J3QMS7 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm11236J3QMS7 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm11236J3QMS7 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm11236J3QMS7 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm11236J3QMS7 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm11236J3QMS7 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm11236J3QMS7 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm11236J3QMS7 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm11236J3QMS7 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm11236J3QMS7 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm11236J3QMS7 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm11236J3QMS7 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm11236J3QMS7 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm11236J3QMS7 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm11236J3QMS7 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm11236J3QMS7 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm11236J3QMS7 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm11236J3QMS7 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm11236J3QMS7 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm11236J3QMS7 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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