Protein–RNA interactions for Protein: H3BJN7

Gm20696, Predicted gene 20696, mousemouse

Predictions only

Length 74 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20696H3BJN7 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm20696H3BJN7 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm20696H3BJN7 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm20696H3BJN7 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm20696H3BJN7 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Gm20696H3BJN7 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm20696H3BJN7 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm20696H3BJN7 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm20696H3BJN7 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm20696H3BJN7 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm20696H3BJN7 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm20696H3BJN7 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm20696H3BJN7 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm20696H3BJN7 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm20696H3BJN7 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm20696H3BJN7 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm20696H3BJN7 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm20696H3BJN7 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm20696H3BJN7 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm20696H3BJN7 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm20696H3BJN7 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm20696H3BJN7 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm20696H3BJN7 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm20696H3BJN7 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm20696H3BJN7 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm20696H3BJN7 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Gm20696H3BJN7 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20696H3BJN7 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20696H3BJN7 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20696H3BJN7 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20696H3BJN7 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20696H3BJN7 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20696H3BJN7 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20696H3BJN7 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20696H3BJN7 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20696H3BJN7 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20696H3BJN7 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20696H3BJN7 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20696H3BJN7 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20696H3BJN7 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20696H3BJN7 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20696H3BJN7 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20696H3BJN7 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20696H3BJN7 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20696H3BJN7 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20696H3BJN7 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20696H3BJN7 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20696H3BJN7 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20696H3BJN7 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20696H3BJN7 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20696H3BJN7 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20696H3BJN7 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20696H3BJN7 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20696H3BJN7 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20696H3BJN7 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20696H3BJN7 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20696H3BJN7 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20696H3BJN7 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20696H3BJN7 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20696H3BJN7 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Gm20696H3BJN7 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20696H3BJN7 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20696H3BJN7 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20696H3BJN7 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20696H3BJN7 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20696H3BJN7 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20696H3BJN7 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20696H3BJN7 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20696H3BJN7 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20696H3BJN7 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20696H3BJN7 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20696H3BJN7 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20696H3BJN7 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20696H3BJN7 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20696H3BJN7 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20696H3BJN7 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20696H3BJN7 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20696H3BJN7 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20696H3BJN7 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20696H3BJN7 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20696H3BJN7 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20696H3BJN7 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20696H3BJN7 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20696H3BJN7 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20696H3BJN7 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20696H3BJN7 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20696H3BJN7 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20696H3BJN7 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20696H3BJN7 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20696H3BJN7 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20696H3BJN7 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20696H3BJN7 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20696H3BJN7 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20696H3BJN7 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20696H3BJN7 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20696H3BJN7 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20696H3BJN7 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Gm20696H3BJN7 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20696H3BJN7 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Gm20696H3BJN7 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.4 ms