Protein–RNA interactions for Protein: G3X9U3

Vmn1r58, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r58G3X9U3 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Vmn1r58G3X9U3 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Vmn1r58G3X9U3 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Vmn1r58G3X9U3 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Vmn1r58G3X9U3 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Vmn1r58G3X9U3 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Vmn1r58G3X9U3 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Vmn1r58G3X9U3 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Vmn1r58G3X9U3 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Vmn1r58G3X9U3 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Vmn1r58G3X9U3 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Vmn1r58G3X9U3 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Vmn1r58G3X9U3 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Vmn1r58G3X9U3 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Vmn1r58G3X9U3 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Vmn1r58G3X9U3 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Vmn1r58G3X9U3 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Vmn1r58G3X9U3 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Vmn1r58G3X9U3 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Vmn1r58G3X9U3 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Vmn1r58G3X9U3 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Vmn1r58G3X9U3 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Vmn1r58G3X9U3 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Vmn1r58G3X9U3 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Vmn1r58G3X9U3 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Vmn1r58G3X9U3 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Vmn1r58G3X9U3 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Vmn1r58G3X9U3 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Vmn1r58G3X9U3 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Vmn1r58G3X9U3 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Vmn1r58G3X9U3 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Vmn1r58G3X9U3 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Vmn1r58G3X9U3 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Vmn1r58G3X9U3 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Vmn1r58G3X9U3 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Vmn1r58G3X9U3 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Vmn1r58G3X9U3 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Vmn1r58G3X9U3 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Vmn1r58G3X9U3 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Vmn1r58G3X9U3 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Vmn1r58G3X9U3 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Vmn1r58G3X9U3 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Vmn1r58G3X9U3 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Vmn1r58G3X9U3 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Vmn1r58G3X9U3 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Vmn1r58G3X9U3 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Vmn1r58G3X9U3 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.39
Vmn1r58G3X9U3 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Vmn1r58G3X9U3 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Vmn1r58G3X9U3 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Vmn1r58G3X9U3 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Vmn1r58G3X9U3 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Vmn1r58G3X9U3 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Vmn1r58G3X9U3 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Vmn1r58G3X9U3 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Vmn1r58G3X9U3 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Vmn1r58G3X9U3 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Vmn1r58G3X9U3 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Vmn1r58G3X9U3 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Vmn1r58G3X9U3 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Vmn1r58G3X9U3 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Vmn1r58G3X9U3 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Vmn1r58G3X9U3 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Vmn1r58G3X9U3 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Vmn1r58G3X9U3 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Vmn1r58G3X9U3 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Vmn1r58G3X9U3 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
Vmn1r58G3X9U3 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Vmn1r58G3X9U3 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Vmn1r58G3X9U3 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Vmn1r58G3X9U3 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Vmn1r58G3X9U3 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Vmn1r58G3X9U3 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Vmn1r58G3X9U3 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Vmn1r58G3X9U3 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Vmn1r58G3X9U3 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Vmn1r58G3X9U3 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Vmn1r58G3X9U3 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Vmn1r58G3X9U3 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Vmn1r58G3X9U3 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Vmn1r58G3X9U3 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Vmn1r58G3X9U3 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Vmn1r58G3X9U3 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Vmn1r58G3X9U3 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Vmn1r58G3X9U3 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Vmn1r58G3X9U3 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Vmn1r58G3X9U3 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Vmn1r58G3X9U3 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Vmn1r58G3X9U3 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Vmn1r58G3X9U3 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Vmn1r58G3X9U3 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Vmn1r58G3X9U3 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Vmn1r58G3X9U3 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Vmn1r58G3X9U3 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Vmn1r58G3X9U3 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Vmn1r58G3X9U3 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Vmn1r58G3X9U3 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Vmn1r58G3X9U3 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Vmn1r58G3X9U3 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Vmn1r58G3X9U3 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms