Protein–RNA interactions for Protein: G3X9K3

Arfgef1, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,846 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef1G3X9K3 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Arfgef1G3X9K3 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Arfgef1G3X9K3 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Arfgef1G3X9K3 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Arfgef1G3X9K3 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Arfgef1G3X9K3 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Arfgef1G3X9K3 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Arfgef1G3X9K3 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Arfgef1G3X9K3 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Arfgef1G3X9K3 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Arfgef1G3X9K3 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Arfgef1G3X9K3 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Arfgef1G3X9K3 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Arfgef1G3X9K3 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Arfgef1G3X9K3 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Arfgef1G3X9K3 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Arfgef1G3X9K3 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Arfgef1G3X9K3 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Arfgef1G3X9K3 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Arfgef1G3X9K3 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Arfgef1G3X9K3 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Arfgef1G3X9K3 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Arfgef1G3X9K3 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Arfgef1G3X9K3 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Arfgef1G3X9K3 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Arfgef1G3X9K3 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Arfgef1G3X9K3 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Arfgef1G3X9K3 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Arfgef1G3X9K3 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Arfgef1G3X9K3 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Arfgef1G3X9K3 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Arfgef1G3X9K3 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Arfgef1G3X9K3 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Arfgef1G3X9K3 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Arfgef1G3X9K3 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Arfgef1G3X9K3 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Arfgef1G3X9K3 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Arfgef1G3X9K3 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Arfgef1G3X9K3 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Arfgef1G3X9K3 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Arfgef1G3X9K3 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Arfgef1G3X9K3 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Arfgef1G3X9K3 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Arfgef1G3X9K3 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Arfgef1G3X9K3 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Arfgef1G3X9K3 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Arfgef1G3X9K3 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Arfgef1G3X9K3 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Arfgef1G3X9K3 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Arfgef1G3X9K3 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Arfgef1G3X9K3 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Arfgef1G3X9K3 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Arfgef1G3X9K3 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Arfgef1G3X9K3 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Arfgef1G3X9K3 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Arfgef1G3X9K3 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Arfgef1G3X9K3 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Arfgef1G3X9K3 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Arfgef1G3X9K3 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Arfgef1G3X9K3 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Arfgef1G3X9K3 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Arfgef1G3X9K3 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Arfgef1G3X9K3 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Arfgef1G3X9K3 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Arfgef1G3X9K3 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Arfgef1G3X9K3 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Arfgef1G3X9K3 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Arfgef1G3X9K3 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Arfgef1G3X9K3 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Arfgef1G3X9K3 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Arfgef1G3X9K3 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Arfgef1G3X9K3 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Arfgef1G3X9K3 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Arfgef1G3X9K3 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Arfgef1G3X9K3 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Arfgef1G3X9K3 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Arfgef1G3X9K3 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Arfgef1G3X9K3 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Arfgef1G3X9K3 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Arfgef1G3X9K3 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Arfgef1G3X9K3 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Arfgef1G3X9K3 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Arfgef1G3X9K3 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Arfgef1G3X9K3 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Arfgef1G3X9K3 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Arfgef1G3X9K3 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Arfgef1G3X9K3 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Arfgef1G3X9K3 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Arfgef1G3X9K3 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Arfgef1G3X9K3 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Arfgef1G3X9K3 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Arfgef1G3X9K3 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Arfgef1G3X9K3 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Arfgef1G3X9K3 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Arfgef1G3X9K3 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Arfgef1G3X9K3 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Arfgef1G3X9K3 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Arfgef1G3X9K3 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Arfgef1G3X9K3 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Arfgef1G3X9K3 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.2 ms